Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm12169-201ENSMUST00000109228 1065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Gm5861F6VCN9 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Gm5861F6VCN9 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms