Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm44225-201ENSMUST00000203582 186 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr730-201ENSMUST00000051453 957 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms