Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Igfl3-201ENSMUST00000152973 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700047A11Rik-202ENSMUST00000153552 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm45042-201ENSMUST00000207377 211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms