Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 P2ry12-201ENSMUST00000050360 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms