Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Adipor2-201ENSMUST00000032272 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Q9D2Q3 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q9D2Q3 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q9D2Q3 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Q9D2Q3 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q9D2Q3 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Q9D2Q3 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms