Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc47Q9D024 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc47Q9D024 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Ccdc47Q9D024 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Ccdc47Q9D024 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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