Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC139754.2-201ENSMUST00000218037 1455 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Atg4aQ8C9S8 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atg4aQ8C9S8 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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