Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm6185-202ENSMUST00000212885 2692 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12237-201ENSMUST00000120158 470 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Chchd7-204ENSMUST00000119403 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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NipblQ6KCD5 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
NipblQ6KCD5 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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