Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm38697-201ENSMUST00000198061 1746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Tff3Q62395 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms