Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Magi2-207ENSMUST00000197553 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Klhdc9Q3USL1 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Klhdc9Q3USL1 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Klhdc9Q3USL1 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Klhdc9Q3USL1 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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