Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm7879-202ENSMUST00000200338 635 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Slc44a1-202ENSMUST00000107645 2365 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Klhl5-201ENSMUST00000101191 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm15028-201ENSMUST00000120295 370 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Znf48Q3US17 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms