Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Zranb3-203ENSMUST00000112538 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Sntn-201ENSMUST00000061045 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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Q3U6N9 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Q3U6N9 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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