Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1166-201ENSMUST00000099833 1628 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Cox11-202ENSMUST00000099960 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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