Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Igkv19-93-201ENSMUST00000183936 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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Ctdnep1Q3TP92 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ctdnep1Q3TP92 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms