Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr888-202ENSMUST00000211851 2930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms