Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
PtprmP28828 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
PtprmP28828 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Svil-210ENSMUST00000140448 7423 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Helz2-202ENSMUST00000108831 10109 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PtprmP28828 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
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