Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC123533.2-201ENSMUST00000228176 375 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
RxraP28700 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ltf-209ENSMUST00000198884 616 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RxraP28700 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Hephl1-201ENSMUST00000159985 5261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RxraP28700 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms