Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Tmem253-204ENSMUST00000228408 415 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gabra6P16305 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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