Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P10404 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P10404 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
P10404 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P10404 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
P10404 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm12306-201ENSMUST00000117256 171 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm8624-202ENSMUST00000165677 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Mrpl24-201ENSMUST00000019854 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
P10404 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms