Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PdgfrbP05622 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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