Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Mir296-201ENSMUST00000083587 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smim18J3QNP2 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms