Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r30-201ENSMUST00000078890 1053 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Smt3h1-ps-201ENSMUST00000117126 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm19653-201ENSMUST00000204326 1039 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms