Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 A730017L22Rik-201ENSMUST00000128176 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Grik3B1AS29 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms