Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm31763-203ENSMUST00000219739 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms