Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp29Q9ES63 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp29Q9ES63 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms