Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm29181-201ENSMUST00000191288 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1g1-213ENSMUST00000206528 1740 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21292-202ENSMUST00000190329 1225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm20751-201ENSMUST00000210260 1270 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Gstk1-201ENSMUST00000031897 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc97Q9DBT3 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms