Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tubgcp4Q9D4F8 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms