Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm24454-201ENSMUST00000083349 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Ccdc47Q9D024 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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