Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp16Q99LG0 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp16Q99LG0 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Usp16Q99LG0 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Usp16Q99LG0 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms