Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Fam20bQ8VCS3 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms