Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms