Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm14870-201ENSMUST00000118414 156 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Pilrb2-202ENSMUST00000196162 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 1700003I22Rik-201ENSMUST00000186048 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Snx17Q8BVL3 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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