Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Nat10-201ENSMUST00000028608 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Mettl16-205ENSMUST00000141755 12584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm37139-201ENSMUST00000192134 4419 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Elp2-201ENSMUST00000025120 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Palb2-202ENSMUST00000098068 3750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Rps27a-201ENSMUST00000102844 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Sat2-202ENSMUST00000108656 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm15516-201ENSMUST00000117292 193 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm23382-201ENSMUST00000157678 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm29068-201ENSMUST00000191607 400 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm30275-201ENSMUST00000197620 498 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
ClmQ7TSN2 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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