Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Usp19Q3UJD6 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Usp19Q3UJD6 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Usp19Q3UJD6 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Usp19Q3UJD6 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Usp19Q3UJD6 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Usp19Q3UJD6 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms