Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 4930517E11Rik-201ENSMUST00000129584 1457 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Vpreb1P13372 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms