Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Rpl9-ps8-201ENSMUST00000198343 562 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37864-201ENSMUST00000195308 3075 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 C1s1-203ENSMUST00000160505 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm44896-201ENSMUST00000206190 772 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm45608-201ENSMUST00000210948 389 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Cldn34c3J3QJW5 Gm18226-201ENSMUST00000215261 521 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms