Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm15425-201ENSMUST00000119013 2711 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-M1F7CXU4 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms