Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usf3B2RUQ2 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms