Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Ube4bos1-201ENSMUST00000141259 2227 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Epha4-201ENSMUST00000027451 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrfQ9JM73 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms