Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Mir455-201ENSMUST00000093594 82 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm6401-202ENSMUST00000164232 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Rabgef1Q9JM13 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Rabgef1Q9JM13 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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