Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24286-201ENSMUST00000157632 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Stc1-201ENSMUST00000014957 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1930-201ENSMUST00000158799 84 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms