Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm11341-201ENSMUST00000122316 447 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm38377-201ENSMUST00000193253 3772 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm17333-201ENSMUST00000169531 378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Ccdc47Q9D024 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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