Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19007-201ENSMUST00000217746 874 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Nhlrc3Q8CCH2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms