Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Ccdc88cQ6VGS5 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Ccdc88cQ6VGS5 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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