Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm34368-201ENSMUST00000209512 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1448-201ENSMUST00000054737 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Sft2d1Q5SSN7 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms