Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Shank3Q4ACU6 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Plec-221ENSMUST00000171562 14944 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Plec-204ENSMUST00000072692 14944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Shank3Q4ACU6 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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