Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trafd1Q3UDK1 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.7 ms