Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Trim71Q1PSW8 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26974-201ENSMUST00000182054 875 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm15354-201ENSMUST00000132019 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Trim71Q1PSW8 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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