Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BckdhaP50136 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms