Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprkP35822 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprkP35822 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprkP35822 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
PtprkP35822 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
PtprkP35822 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms